南澳神社创建於日据时代昭和11年（1936）10月，当时日本治台逐渐进入战
时体制，改派军人出任台湾总督，并积极进行军国主义的皇民教育，提出了「一
街一庄一神社」的口号。这个时期，日本神社如雨後春笋般的纷纷出现在台湾的
土地上。 「南澳神社」正式的名称为「南澳祠」。神祠是规模较小的神社，通常
设置於较偏远及人口较少的山地部落，一些神社的附属设施，如神马、犬、石
灯笼等都省略，而仅设置核心的建筑，例如如正殿、拜殿、叁道等。